زمینه های تحقیقاتی مرکز تحقیقات تکنولوژی بهداشت محیط شامل:
- بهره مندی از تکنولوژی های نوین در جهت تصفیه استفاده مجدد از آب
- بهره مندی از تکنولوژی های نوین تصفیه و استفاده مجدد از فاضلاب
- مدیریت و کنترل آلودگی هوا
- پایش و ارزیابی آلودگی هوا
- کمی سازی اثرات بهداشتی آلودگی هوا
- کنترل آلودگی صوتی
- آلودگی خاک
- مدیریت پسماندهای شهری، خطرناک، ویژه، صنعتی، بیمارستانی و...
- بهداشت و ایمنی مواد غذایی
- علوم تغذیه
- اپیدمیولوژی محیط
- بهداشت پرتوها
- سم شناسی محیط
- ارزیابی اثرات زیست محیطی(EIA)
- روش های مهندسی کنترل و مبارزه با ناقلین و حشرات
- بهداشت محیط در شرایط اضطراری